学院有计算机科学与技术（智能金融与区块链金融“双A”联合学位实验班）、计算机科学与技术（“互联网+”复合型精英人才双学位培养计划）、人工智能、计算机类(计算机科学与技术、网络空间安全、数字媒体技术、数据科学与大数据技术)4个本科专业。且计算机科学与技术、网络空间安全为国家级特色专业，现有在校生3500余人，其中本科生近1800人，硕博研究生1500余人，留学生近200人。

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智能科学学院起源于哈尔滨军事工程学院时期的带翼式导弹自动控制、导航飞行原理射击原理与飞行试验、引爆控制以及长沙工学院时期的机械与仪器加工工艺及设备等学科专业，2017年，由原国防科学技术大学机电工程与自动化学院调整组建而成，现位于国防科技大学一号教学园区。学院的使命任务是面向智能无人作战重大战略需求，聚焦人工智能、生物智能、混合智能，做智能时代“无人区”人才培养和科学研究的开拓者。